¿ se puede utilizar la espectrometría de masas para la secuenciación de proteínas - biotecnológica baitaipaike

¿ se puede utilizar la espectrometría de masas para la secuenciación de proteínas - biotecnológica baitaipaikeIntroducción detallada de los servicios técnicos de detección

I. Antecedentes

La secuenciación de dànbáizhì permite revelar directamente la secuencia de aminoácidos de dànbáizhì, que es la base para comprender la estructura y función de dànbáizhì. Después de la secuenciación de la proteína, se puede predecir aún más la estructura tridimensional de dànbáizhì, y luego analizar sus funciones biológicas y mecanismos de interacción. Esto es de gran importancia para revelar los misterios de las actividades vitales y comprender la aparición y el desarrollo de enfermedades. Las técnicas actuales de secuenciación de proteínas son principalmente: secuenciación de Novo por espectrometría de masas, degradación de Edelman y secuenciación de nanoporos. En la actualidad, se aplica más la secuenciación de dànbáizhì desde cero basada en la espectrometría de masas. La secuenciación de Novo Protein es una nueva técnica de secuenciación que no depende de ninguna secuencia conocida o de la información de la base de datos de dànbáizhì para determinar directamente la secuencia de aminoácidos de dànbáizhì, una técnica que destaca especialmente su papel en la identificación de nuevas proteínas. Los anticuerpos, como molécula de bìbùkěsh ǎ o en nuestro sistema inmunológico, son herramientas valiosas en el campo del diagnóstico y tratamiento médico, y la secuenciación de dànbáizhì desde cero tiene una aplicación importante en el campo de los anticuerpos.

II. procesos técnicos

La secuenciación de dànbáizhì basada en la espectrometría de masas consiste en utilizar un espectrómetro de masas para recopilar información de calidad sobre la secuencia de aminoácidos del segmento del péptido, es decir, un espectro de segundo orden, y analizar directamente la secuencia del segmento del péptido del espectro de masas de segundo orden a través de un algoritmo de secuenciación AB initio. después de empalmar la secuencia, se obtiene la secuencia completa de aminoácidos de dànbáizhì. El proceso técnico de secuenciación de zhì P ǔ f ǎ dànbáizhì es el siguiente: preparación de muestras → enzima dànbáizhì → separación de segmentos de péptidos → detección de espectrometría de masas → análisis de datos. Los asuntos a los que hay que prestar atención en la secuenciación de zhì P ǔ f ǎ dànbáizhì son los siguientes: ① durante la preparación de la muestra, trate de evitar la degradación de dànbáizhì; ② seleccionar la enzima adecuada para la enzima dànbáizhì; ③ garantizar el rendimiento estable del espectrómetro de masas y mejorar la precisión de los datos.

III. lista de casos de estudio

La gammaglobulosis monoclonal (mgus) es una enfermedad de células plasmáticas caracterizada por la presencia en el suero de un Anticuerpo monoclonal importante (es decir, la proteína m). Los autores detectaron la proteína M del tipo igg1 en el suero humano mediante análisis de Cromatografía líquida - espectrometría de masas. La proteína m fue extraída enzimáticamente con una variedad de proteasas, y el segmento de péptido de anticuerpos fue analizado por secuenciación AB initio. después del empalme del segmento de péptido, zuì finalmente determinó la secuencia de cadena pesada y ligera de la proteína m completa. Además, los autores caracterizaron los niveles de Glicosilación en la región del CDR de anticuerpos.

La secuenciación de la espectrometría de masas dànbáizhì ayuda a descubrir nuevas dianas farmacéuticas y proporciona información clave para el diseño y selección de fármacos. A través de técnicas de secuenciación, los científicos pueden identificar los dànbáizhì relacionados con la enfermedad y, a su vez, diseñar medicamentos para estos dànbáizhì para lograr el tratamiento de jàngzhàn. Con la técnica de secuenciación de dànbáizhì, los médicos pueden evaluar más a fondo el Estado de la enfermedad del paciente y predecir la tendencia de progresión de la enfermedad, desarrollando así un plan de tratamiento más personalizado. Esto no solo puede mejorar el efecto del tratamiento, sino también reducir los efectos secundarios y mejorar la calidad de vida de los pacientes.

Beijing baitaipaike Biotechnology co., Ltd. ha desarrollado un software de análisis de secuencias de anticuerpos basado en la literatura publicada en la revista proteómica jpr de Nature Biotechnology y zhuānyè, combinado con el conocimiento de fondo existente de zhuānyè, con un método de cálculo de datos brutos de espectrometría de masas autodesarrollado, utilizando el principio de entrada amplia y salida estrecha, logrando una identificación precisa de secuencias de anticuerpos / proteínas sin omitir ninguna información de datos válida. Durante el proceso de secuenciación, se utilizarán los espectrómetros de masas orbitrap eclipse y orbitrap Fusion lumos, que actualmente tienen una alta resolución y sensibilidad zuì, para garantizar la calidad de los datos y la precisión de los resultados. El ciclo del proyecto de secuenciación de proteínas / anticuerpos es de 3 a 4 semanas.

IV. referencias documentales

[1] Albert, Denboer, Arjand, et al. Detección basada en espectrometría de masas directa y secuenciación de anticuerpos de gamopatía monoclonal de importancia indeterminada del suero del paciente: un estudio de caso [J]. Journal of Proteome Research, 2023, 22(9): 3022-3028.

[2] Bandeira N, Pham V, Pevzner P, et al. Secuenciación automatizada de proteína de novo de anticuerpos monoclonales [J]. Naturaleza Biotecnología, 2008, 26(12):1336-1338

Proyecto característico de biotecnología de baitaipaike

I. secuenciación de proteínas

La biotecnología de baitepec utiliza el recién lanzado espectrómetro de masas obitrap Fusion Lumos de la compañía Thermo y el sistema de secuenciación de degradación Edelman de la compañía Shimadzu para analizar la secuencia de dànbáizhì, proporcionando servicios de análisis de secuenciación de proteínas basados es en espectrometría de masas, incluyendo análisis de la composición de aminoácidos de dànbáizhì, análisis de secuencia completa de nduàncès, cduàncès y servicio de análisis de secuencia final de dànbáizhìn basado en la degradación de edelman. Para las secuencias teóricas desconocidas de dànbáizhì, se ofrece un servicio de secuenciación de dànbáizhì basado en el método de secuenciación de novo para analizar las secuencias de proteínas.

※ ventajas de servicio:

1. adoptar el instrumento de espectrometría de masas avanzado actual en el mundo, obitrap Fusion lumos;

2. se puede lograr una cobertura del 100% de la secuencia de proteínas Diana determinada;

3. se pueden determinar hasta 70 secuencias de aminoácidos en el extremo n de la proteína;

4. se pueden determinar diversas formas de muestras: soluciones proteicas, bandas proteicas pvdf;

5. baja cantidad de muestra: la muestra de proteína solo necesita 5 - 10ug para completar la prueba;

6. la secuenciación no se ve afectada por modificaciones del extremo n, como el cierre del extremo n, la Pec y la glicosilación.

II. Grupo dànbáizhì

La biotecnología de baitepec utiliza la Plataforma de espectrometría de masas orbitrap Fusion Lumos de Thermo Fisher combinada con Nano - LC para proporcionar una variedad de servicios de análisis de histología dànbáizhì cuantitativos, histología dànbáizhì dirigida, histología polipéptida, proteómica modificada posttraduccional y así sucesivamente. Además, baitaipaike Biotechnology ha lanzado recientemente un servicio de histología 4dànbáizhì basado en timstof pro para ayudar en la investigación de la proteómica de muestras trazas, la medicina de grupos de muestras grandes y la histología modificada de alto rendimiento.

※ ventajas de servicio:

1. Análisis cuantitativo de proteínas de alto rendimiento: Análisis experimental a gran escala en grupos de control múltiple, se encontraron nuevos biomarcadores;

2. una variedad de métodos de marcado dànbáizhì in vivo e in vitro, adecuados para analizar tejidos, células, sangre y otras muestras;

3. la sensibilidad del análisis de espectrometría de masas es alta y la repetición de los resultados experimentales es alta;

4. se pueden detectar proteínas de baja abundancia con un amplio rango lineal;

5. análisis bioinformático de zhuānyè, el análisis es más sistemático y preciso.

3. análisis de la tecnología de flujo de espectrometría de masas unicelular

La biotecnología de baitepec utiliza el sistema de flujo de espectrometría de masas fluidigm para el análisis de la tecnología de flujo de espectrometría de masas unicelular, marcadores de elementos metálicos (generalmente anticuerpos específicos marcados con elementos metálicos) para etiquetar moléculas en la superficie y el interior de las células, luego separa las células individuales con principios de células de flujo, y luego analiza El espectro de masa atómica de las células individuales con espectrometría de masas de plasma acoplado inductivamente (icp - ms), después de lo cual zuì convierte los datos del espectro de masa atómica en expresiones moleculares de señal en la superficie y el interior de las células.

※ ventajas de servicio:

1. tecnología avanzada para llenar las lagunas tecnológicas

La tecnología de anticuerpos marcados con Metal evita el problema de que los canales de fluorescencia de flujo tradicionales son pequeños y fáciles de interactuar. Se pueden caracterizar varios indicadores simultáneamente a nivel unicelular, y la biotecnología baitaipaike puede detectar 51 proteínas objetivo al mismo tiempo.

2. gran cantidad de análisis y bajo costo

El rnaseq unicelular está limitado por factores como el costo, y el número de análisis agregados por todas las células de la muestra es generalmente de unos 2x10,4, mientras que la espectrometría de masas de flujo (muestra única) puede analizar al menos 10,5 células a la vez, logrando un aumento de magnitud y el costo no es superior al rnaseq unicelular.

3. grandes perspectivas de aplicación

① los resultados de la espectrometría de masas de flujo pueden dar cambios en los subgrupos celulares y tienen grandes perspectivas de investigación en el diagnóstico clínico y la investigación del mecanismo de la enfermedad;

② la combinación de la tecnología de etiquetas metálicas con otras tecnologías tendrá nuevas direcciones de aplicación. Además de las proteínas convencionales, la tecnología de células de flujo de espectrometría de masas también se puede utilizar para modificar las proteínas después de la traducción;

③ se puede detectar la tasa de supervivencia celular, el tamaño celular, la expresión del transcriptor de arnm, la tasa de síntesis de ADN y la actividad de la proteasa.

IV. análisis de la histología de los péptidos inmunológicos y descubrimiento de nuevos antígenos basados en espectrometría de masas de alta precisión

Las soluciones de ventanilla única para el análisis de la histología de péptidos inmunológicos y el descubrimiento de nuevos antígenos basadas en espectrometría de masas de alta precisión de baitaipaike Biotechnology incluyen nuestro programa exclusivo y altamente sensible de enriquecimiento e identificación de péptidos inmunológicos. Podemos ayudarle a lograr la identificación y reconocimiento de más de 10000 polipéptidos de tipo I y más de 10000 polipéptidos de tipo II. A través de nuestra plataforma de análisis de inmunopéptidos de alto rendimiento optimizada para el análisis de inmunopéptidos, se puede realizar un reconocimiento repetible y cuantificación a partir de materiales de muestra pequeños de zuì. El Servicio se puede aplicar a la investigación a gran escala y tiene como objetivo ayudar a los investigadores científicos a encontrar soluciones para el cáncer, las enfermedades inmunológicas y las enfermedades infecciosas, profundizando en objetivos desconocidos.

V. caracterización de los medicamentos biológicos

Basado en la tecnología de espectrometría de masas de alta resolución, baitaipaike, MALDI TOF， Tecnología de separación por cromatografía de alto rendimiento, que ofrece una serie de programas de análisis biofarmacéutico de vánshàn, desde el análisis de la composición de aminoácidos y la estructura primaria de productos biológicos como dànbáizhì, polipéptidos, anticuerpos y vacunas, hasta el análisis de la variabilidad y pureza del producto. El objetivo es proporcionar servicios de análisis de medicamentos biológicos de alta calidad para ayudar a los productores de medicamentos biológicos a mejorar la calidad de los medicamentos biológicos.

Siete plataformas de detección de biotecnología de baitaipaike

Baitaipaike biotechnology - caracterización de productos biológicos, espectrometría de masas biológica multigrupo proveedor de servicios de alta calidad

Beijing baitaipaike Biotechnology co., Ltd. se compromete a proporcionar servicios de zhuānyè, como pruebas de control de calidad y verificación de proyectos para la industria biológica / farmacéutica y de dispositivos médicos. Siguiendo las regulaciones y principios rectores de nmpa, ich, FDA y ema, el laboratorio de la compañía ha establecido un sistema de calidad completo a través de la certificación del sistema de doble calidad CNAS / iso9001, copias de Seguridad de datos fríos y calientes / en diferentes lugares, medición regular / verificación de período de equipos, seguimiento de auditoría de software, soluciones integradas y servicios técnicos para clientes, apoyando el desarrollo de nuevos medicamentos, registro de declaraciones de medicamentos y liberación de producción.

1. la compañía adopta el sistema de control de calidad iso9001, y zhuānyè ofrece servicios de detección y análisis de Cro basados es es en espectrometría de masas;

2. ser reconocido por el Laboratorio Nacional CNAS para proporcionar a los clientes servicios de investigación de calidad de medicamentos que cumplan con las regulaciones farmacéuticas globales;

3. el ámbito de negocio abarca la histología dànbáizhì, la histología polipéptida, la metabolómica, la caracterización biofarmacéutica, el análisis unicelular, el flujo de espectrometría de masas unicelular, el análisis en la nube de shengxin y el análisis integrado de espectrometría de masas biológica multigenómica;

4. siete plataformas de inspección de control de calidad para satisfacer sus necesidades de servicio de ventanilla única;

5. servir a más de 3.000 empresas y la elección de más de 10.000 clientes;

¡6. ¡ comprometido a proporcionarle servicios de análisis de espectrometría de masas biológica de alta calidad!

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