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Estación de trabajo totalmente automática de secuenciación de tres generaciones de nanoporos

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Descripción general

Elysion es un conjunto de estaciones de trabajo automáticas de secuenciación de tres generaciones de nanoporos, que incluye equipos de preparación de muestras, secuenciadores de nanoporos minion mk1d y unidades de control elysion minion complementarias. La Mesa de trabajo del equipo de preparación de muestras integra minion mk1d, mientras que la unidad de control preinstala el software de secuenciación y el sistema linux, y utiliza el equipo de preparación de muestras conectado a Ethernet para realizar la transmisión bidireccional de datos, que puede controlar la secuenciación, almacenar la capacidad de almacenamiento de archivos de 6,7tb, y también puede hacer Análisis aguas abajo a través del proceso de bioinformática para proporcionar servicios de extremo a extremo "de muestra a resultado".

Detalles del producto

I. Resumen del producto

Elysion fue lanzado por Oxford nanopore TechnologyEstación de trabajo totalmente automática de secuenciación de tres generaciones de nanoporos,ProporcionardesdeSolución completa para la secuenciación de nanoporos "muestra a resultado" totalmente automáticaCon el fin de simplificar el diseño del flujo de trabajo de la genómica, a través de la integración de todo el módulo de proceso, varios laboratorios pueden llevar a cabo investigaciones de secuenciación eficientes sin operaciones complejas.

El núcleo del programa consta de tres partes: una es integrar la función de tratamiento de líquidos.Equipo de preparación de muestrasSe pueden automatizar los pasos de preprocesamiento, como la extracción de ácidos nucleicos y la construcción de bibliotecas, sin intervención manual; El segundo es integrado en la Mesa de trabajo del equipo de preparación.Secuenciador minion mk1dContinuar la ventaja de la lectura de longitud de nanoporos; El tercero es el apoyo.Unidad de control elysion minionComo centro para lograr el control de todo el proceso.
Estación de trabajo totalmente automática de secuenciación de tres generaciones de nanoporosLa unidad de control está equipada con un sistema Linux y un software de secuenciación, que transmiten datos en ambas direcciones a través de Ethernet y el equipo de preparación, almacena 6.7tb para conservar archivos de secuenciación masivos, y el proceso bioinformático incorporado puede completar automáticamente el reconocimiento de bases, el análisis de secuencias y la generación de informes, logrando verdaderamente un servicio de extremo a extremo "de muestra a resultado". Sus características de automatización reducen drásticamente el umbral de operación, desde el lisado hasta el informe rápido es de 4 horas, una sola ronda puede procesar 1 - 96 muestras, adaptadas a diferentes escalas experimentales.

纳米孔三代测序全自动工作站

II. tecnologías básicas

La secuenciación de Oxford nanopore se basa en la tecnología de detección monomolecular nanoporoso. En el momento de la secuenciación, las moléculas de ácido nucleico (adn / arn) pasan a través de nanoporos una por una en forma de cadena única, impulsadas por la enzima motora. Cuando pasan las bases, se cambia la intensidad de la corriente en el nanoagujero, y hay diferencias en las señales de corriente correspondientes a diferentes bases (a, t, c, g) y bases modificadas. El dispositivo capta estos cambios de corriente en tiempo real y pasa por minknow ™ Otros programas informáticos se convierten en secuencias de bases para lograr la secuenciación directa de moléculas únicas. Esta tecnología no requiere amplificación pcr, puede conservar información de modificación de base y la longitud de lectura no es limitada, lo que puede realizar análisis de datos en tiempo real, con portabilidad y eficiencia.

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III. ventajas del rendimiento básico

Esquema inteligente de ventanilla única, umbral profesional cero: realizar la investigación genómica con una sola solución sin tener conocimientos profesionales de genómica; Equipado con un flujo de trabajo intuitivo de "configuración y operación", la operación es simple y fácil de entender, y los no profesionales también pueden comenzar rápidamente.

Integración totalmente automatizada, amplia aplicación: como solución de secuenciación totalmente automatizada, todo el proceso, desde el procesamiento de muestras hasta la salida de resultados, se puede completar sin intervención manual; Adaptado a una variedad de escenarios de aplicación, puede satisfacer las necesidades de secuenciación en diferentes campos y tiene una fuerte flexibilidad.

Simplificar el proceso de laboratorio, reducir costos y mejorar la eficiencia: simplificar considerablemente el proceso de operación de secuenciación de laboratorio y reducir el tiempo de inversión humana; Al mismo tiempo, se reducen los costos experimentales y el consumo de recursos de capacitación del personal, ahorrando gastos operativos para el laboratorio.

No se necesitan lotes de muestras, los resultados se obtienen rápidamente: soporte para iniciar tareas de secuenciación en cualquier momento, sin esperar a que las muestras se aprueben, reduciendo significativamente el ciclo experimental; Puede generar rápidamente resultados de secuenciación y ayudar a promover la investigación científica y la detección de manera eficiente.

Garantizar la consistencia experimental y adaptarse a las pruebas de rutina: el diseño del equipo admite operaciones experimentales estandarizadas y convencionales, lo que puede reducir los errores de operación humana, garantizar la estabilidad y consistencia de los resultados experimentales y es adecuado para escenarios de detección convencionales de alta frecuencia.

IV. Áreas de aplicación

Investigación sobre enfermedades infecciosas: no es necesario reunir muestras para lotes, se puede iniciar la secuenciación de patógenos de enfermedades infecciosas repentinas (como virus y gripe) en cualquier momento, y el proceso totalmente automatizado produce resultados preliminares en cuatro horas para ayudar a rastrear rápidamente la mutación, monitorear la ruta de transmisión y proporcionar soporte de datos oportuno para la toma de decisiones de prevención y control.

Aislamiento y secuenciación de microorganismosAdaptarse a la secuenciación de cepas aisladas como bacterias y hongos, el proceso de "configuración y operación" no requiere conocimientos genómicos profesionales, puede completar eficientemente la identificación de cepas y la detección de genes resistentes a los medicamentos, simplificar las operaciones de laboratorio, garantizar la coherencia de los resultados y ser adecuado para la construcción de bancos de recursos microbianos.

Verificación de plásmidos: el procesamiento totalmente automatizado evita errores de operación manual, puede verificar rápidamente la integridad de los fragmentos de inserción y secuencias de plásmidos recombinantes, reducir el tiempo humano y los costos de capacitación, y adaptarse a las necesidades convencionales de control de calidad de plásmidos en el campo de la biofarmacéutica y la ingeniería genética.

Genómica humana: como programa de ventanilla única, apoya la secuenciación de áreas específicas del genoma humano (como sitios relacionados con enfermedades), sin necesidad de un diseño de proceso complejo, el almacenamiento 6.7tb puede retener una gran cantidad de datos de muestras y ayudar a los laboratorios de investigación científica a llevar a cabo investigaciones como el análisis de asociación de enfermedades genéticas.

Investigación sobre el cáncer: puede detectar rápidamente las mutaciones genéticas y estructurales de las muestras de tejido tumoral sin esperar por lotes, automatizar completamente el proceso para reducir los errores humanos, proporcionar apoyo de secuenciación eficiente para la clasificación del cáncer y la detección de medicamentos dirigidos, y adaptarse a la investigación clínica y la investigación de diagnóstico y tratamiento individualizados.

MetagenómicaAdaptarse al análisis de muestras macrogenómicas como el medio ambiente y el intestino, automatizar todo el proceso para procesar muestras complejas, puede analizar eficientemente la estructura de la flora y los genes funcionales, simplificar el proceso experimental, garantizar la estabilidad de los resultados de las pruebas de múltiples muestras y ayudar a la investigación de la comunidad microbiana.

Investigación vegetal y animal: apoyar la secuenciación genética de muestras de animales y plantas como cultivos, ganado y aves de corral, como la detección genética resistente a enfermedades y la detección de sitios relacionados con la cría. la operación de "umbral cero" es adecuada para laboratorios de investigación agrícola. no se necesita un equipo profesional para llevar a cabo investigaciones y reducir el costo y el ciclo del proyecto.


V. especificaciones del equipo

especificación ElysION
Equipo de preparación de muestras

Elysion Minión

Unidad de control

ElysION Minion Mk1D
modelo ELY-SPPD001 ELY-CMU001 MIN-101D
Tensión de alimentación (v) 200-240 AC ±10%(50/60 Hz) 200-240 AC ±10%(50/60 Hz) 5 corriente continua
Corriente nominal (a) 10 10 1.5
Potencia nominal (va) 2300 750 7.5
Tamaño (h × W × d, mm) 1096 (1428 al abrir la puerta) × 1190 × 783 300 × 180 × 340 13 × 55 × 125
Peso (kg) 243 9 0.13
Instalar puerto

1 × conexión de energía

Puerto 1 × interfaz Ethernet 1 × interfaz usb - C 3.0

1 × interfaz de alimentación

Interfaz 2 × HDMI

6 × interfaz displayport

Interfaz 2 × Ethernet

Interfaz 4 × usb - a 2.0

Interfaz 1 × usb - C 3.0

Interfaz 1 × usb - C 3.0
Software preinstalado Windows 10BotQL Software de secuenciación Ubuntu 20.04 Controlador minion
Calcular las especificaciones

1 × CPU Intel

16 GB de memoria

Almacenamiento SSD de 500 GB

1 × NVIDIA amps series GPU

1 × CPU Intel (20 núcleos)

64 GB de memoria

6,7 terabytes de almacenamiento SSD

Ninguno
Temperatura ambiente + 5 ° C a + 40 ° C + 5 ° C a + 40 ° C + 5 ° C a + 40 ° C
humedad Humedad relativa entre el 30% y el 60% (sin condensación) Humedad relativa entre el 30% y el 75% (sin condensación) Humedad relativa entre el 30% y el 75% (sin condensación)
Temperatura de secuenciación Temperatura ambiente de secuenciación de diseño: + 20 ° C a + 27 ° C No aplicable (n / a)



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