Secuenciador de tres generaciones de nanoporos promethion 2 integrado

I. Resumen del producto

Secuenciador de tres generaciones de nanoporos promethion 2 integrado(p2i) es un pequeño dispositivo de escritorio diseñado para funcionar hasta dos unidades de velocidad de protoión. Cada unidad de flujo es direccionable de forma independiente, lo que significa que los experimentos se pueden realizar simultáneamente o individualmente. P2i es un producto independiente que incluye computación a nivel empresarial y es responsable de toda la adquisición de datos y la llamada a la dirección base en el equipo. También permite a los usuarios proporcionar servicios de secuenciación de nanoporos.

Secuenciador de tres generaciones de nanoporos promethion 2 integradoContiene dos puertos de secuenciación que se pueden insertar en la unidad de flujo. El dispositivo cuenta con las mismas funciones que el más pequeño promethion 2 solo, pero añade la función de cálculo de * con la GPU NVIDIA Ampere incorporada, capaz de llamar a la base de datos en tiempo real desde dos unidades de flujo promethion. La química y el software actuales permiten generar hasta 290 GBAS * de datos a partir de una sola unidad de flujo promethion (* la salida teórica Max se basa en una secuenciación de 420 bases por segundo, que dura 72 horas).

II. tecnologías básicas

La secuenciación de Oxford nanopore se basa en la tecnología de detección monomolecular nanoporoso. En el momento de la secuenciación, las moléculas de ácido nucleico (adn / arn) pasan a través de nanoporos una por una en forma de cadena única, impulsadas por la enzima motora. Cuando pasan las bases, se cambia la intensidad de la corriente en el nanoagujero, y hay diferencias en las señales de corriente correspondientes a diferentes bases (a, t, c, g) y bases modificadas. El dispositivo capta estos cambios de corriente en tiempo real y pasa por minknow ™ Otros programas informáticos se convierten en secuencias de bases para lograr la secuenciación directa de moléculas únicas. Esta tecnología no requiere amplificación pcr, puede conservar información de modificación de base y la longitud de lectura no es limitada, lo que puede realizar análisis de datos en tiempo real, con portabilidad y eficiencia.

III. ventajas del rendimiento básico

Diseño de escritorio integrado, alta integración:Adopta la forma de un dispositivo de escritorio totalmente autónomo, con un módulo de computación completo incorporado, sin computadoras o servidores externos adicionales, simplificando en gran medida el proceso de despliegue del equipo, ahorrando espacio de laboratorio y adaptándose a varios escenarios científicos y clínicos.

Potencia de cálculo fuerte + control intuitivo, eficiencia sobresaliente:Equipado con GPU de alto rendimiento, proporciona suficiente soporte informático para tareas analíticas complejas como el reconocimiento de bases en tiempo real y el ensamblaje genómico; Equipado con una pantalla incorporada, puede ver directamente el progreso de la secuenciación, la señal de corriente y otra información clave, y la interacción operativa es más conveniente.

Doble flujo de células paralelas, adaptación flexible:Soporte para ejecutar hasta dos células de flujo de protoión al mismo tiempo, se puede seleccionar una secuenciación independiente de un solo canal o un arranque simultáneo de dos canales de acuerdo con las necesidades experimentales, que no sólo puede satisfacer la detección rápida de muestras de pequeños lotes, sino también hacer frente a tareas de secuenciación de flujo medio y alto, y el uso de recursos es más flexible.

Precomputados, Plug and play, el umbral es extremadamente bajo:La fábrica del equipo ha completado la configuración previa del sistema, sin necesidad de depurar parámetros complejos, se puede iniciar el proceso de secuenciación conectando la fuente de alimentación, incluso los técnicos no profesionales pueden comenzar rápidamente, lo que reduce significativamente los costos de operación y mantenimiento.

Soporte de almacenamiento y potencia informática de alto rendimiento:Equipado con un SSD de gran capacidad de 16 terabytes, que puede almacenar datos de secuenciación masivos localmente sin depender de dispositivos de almacenamiento externos; La Ram de alto ancho de banda de 64 GB garantiza el funcionamiento fluido del proceso de lectura, escritura y análisis de datos, junto con la GPU NVIDIA a - series de * para proporcionar una fuerte potencia computacional para el complejo reconocimiento de bases en tiempo real, ensamblaje genómico y análisis de variación, reduciendo en gran medida el tiempo de análisis de datos.

Interacción de alta definición y adaptación flexible:Equipado con una pantalla táctil de alta resolución, puede mostrar claramente información clave como el progreso de la secuenciación, la señal de corriente y los resultados del análisis de datos, y la interacción operativa es más intuitiva y precisa; Al mismo tiempo, admite el acoplamiento de la infraestructura informática existente, que no sólo puede ser fácil de operar a través de pantallas táctiles locales, sino que también puede integrarse en el sistema original del laboratorio, adaptándose con flexibilidad a diferentes hábitos de uso y procesos de trabajo.

IV. Áreas de aplicación

Investigación genómica completaLos datos de 8tb de un solo canal pueden lograr una secuenciación profunda de más de 30 × de todo el Genoma humano, la lectura a largo plazo ayuda al ensamblaje completo del genoma de t2t (telómeros a telómeros) y analiza variaciones estructurales complejas;

Análisis en profundidad del metagenoma: secuenciación profunda del genoma macro que apoya muestras ambientales complejas como el suelo y el océano con alto rendimiento, que puede detectar microorganismos de baja abundancia (menosdel 0,1%) y anotar genes funcionales con precisión;

Pruebas clínicas a gran escala: el doble canal puede procesar cientos de muestras clínicas al mismo tiempo (como la secuenciación del genoma completo del virus), el análisis de datos en tiempo real ayuda a la clasificación rápida y el monitoreo de variantes, y apoya la respuesta de emergencia de salud pública;

Investigación sobre la cría de animales y plantas: proporcionar datos de alto rendimiento y lectura larga para los genomas de animales y plantas grandes (como el trigo y el ganado), ayudar al desarrollo de marcadores moleculares y la construcción de mapas genéticos.

V. especificaciones del equipo

* rango funcional de dispositivos electrónicos + 5ºC a + 40ºC

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