Secuenciador de tres generaciones de nanoporos promethion 24

I. Resumen del producto

II. tecnologías básicas

La secuenciación de Oxford nanopore se basa en la tecnología de detección monomolecular nanoporoso. En el momento de la secuenciación, las moléculas de ácido nucleico (adn / arn) pasan a través de nanoporos una por una en forma de cadena única, impulsadas por la enzima motora. Cuando pasan las bases, se cambia la intensidad de la corriente en el nanoagujero, y hay diferencias en las señales de corriente correspondientes a diferentes bases (a, t, c, g) y bases modificadas. El dispositivo capta estos cambios de corriente en tiempo real y pasa por minknow ™ Otros programas informáticos se convierten en secuencias de bases para lograr la secuenciación directa de moléculas únicas. Esta tecnología no requiere amplificación pcr, puede conservar información de modificación de base y la longitud de lectura no es limitada, lo que puede realizar análisis de datos en tiempo real, con portabilidad y eficiencia.

III. ventajas del rendimiento básico

Secuenciación flexible bajo demanda, sin esperar muestras por lotes:El tiempo y el contenido de la secuenciación se pueden seleccionar de forma independiente de acuerdo con las necesidades, y las unidades móviles admiten el funcionamiento individual o colaborativo, sin necesidad de retrasar el experimento para reunir el tamaño de la muestra; La capacidad de secuenciación de una sola unidad móvil es aproximadamente seis veces mayor que la de la unidad móvil minion, que satisface las necesidades de datos de diferentes escalas.

Laboratorio de servicio de alta velocidad y multitarea paralelo:Apoyar la realización simultánea de múltiples experimentos de ADN o arn, combinados con la tecnología de código de barras, puede aumentar aún más el procesamiento de muestras, responder eficientemente a escenarios de secuenciación de alto rendimiento y proporcionar a los usuarios servicios profesionales de secuenciación de nanoporos.

El umbral de despliegue es bajo y se adapta a varios laboratorios:El equipo cubre un área pequeña y se puede instalar sin transformar las instalaciones de laboratorio existentes; Equipado con soporte técnico integral, simplifica el proceso de despliegue y se puede adaptar fácilmente tanto a pequeños laboratorios de investigación científica como a grandes instituciones de servicios.

Cálculo integrado de alto rendimiento, análisis eficiente y conveniente:Integra funciones de secuenciación y análisis, equipado con una nueva generación de cpu, 4 GPU de la serie NVIDIA a, 60 terabytes de almacenamiento SSD y 512 GB de ram, con una fuerte potencia de cálculo; Preinstalado el sistema operativo Ubuntu y el software minknow, se puede iniciar la secuenciación y el análisis en tiempo real al arrancar, lo que acorta considerablemente el ciclo de adquisición de resultados.

IV. Áreas de aplicación

Secuenciación de grandes genomas o proyectos: ensamblaje de genomas complejos adaptados a humanos, grandes animales y plantas (como arroz, ganado) o grandes proyectos de investigación científica coherentes en varias etapas. Sus 24 unidades de flujo pueden funcionar simultáneamente, con una sola unidad de flujo.Producción de datosMax 200Gb， Por encima de la capacidad de minion aproximadamente6 vecesPuede cubrir rápidamente las secuencias repetidas y las regiones de variación estructural de los genomas grandes, y combinar un análisis en tiempo real con una fuerte potencia computacional para acortar el ciclo del proyecto.

Estudio sobre la secuenciación del tamaño de la población: adecuado para escenarios como el análisis de asociación de enfermedades humanas y la detección de grupos de cría de animales y plantas. Soporte para secuenciación paralela de múltiples muestras, tecnología de código de barras puede procesar cientos de muestras de grupo de manera eficiente, 512 GB de Ram y 4 GPU de la serie NVIDIA a garantizan una comparación rápida y detección de variaciones de datos a gran escala, proporcionando soluciones de alto rendimiento para la investigación de genética de grupo.

Secuenciación de genomas pequeños o áreas dirigidas con alto multiplex: detección por lotes de genomas pequeños como bacterias y hongos, o análisis de áreas dirigidas como genes impulsados por el cáncer humano y dianas de medicamentos. Veinticuatro unidades móviles se pueden dividir para procesar diferentes grupos de muestras, y una sola unidad tiene una alta capacidad para satisfacer las necesidades de cobertura profunda de la zona objetivo, sin esperar muestras por lotes, y se adapta a tareas de secuenciación de alta frecuencia y pequeñas cantidades, como pruebas clínicas y construcción de bancos de recursos microbianos.

Estudio del Transcriptoma completo (arn directo o adnc): apoyar el análisis de corte variable del Transcriptoma completo de animales y plantas y el monitoreo dinámico de la transcripción microbiana. La secuenciación directa del ARN puede conservar información modificada por bases, y la secuenciación de adnc cubre transcripciones de baja abundancia; La capacidad de computación integrada del equipo puede analizar secuencias de transcripciones de longitud completa en tiempo real, evitar errores de empalme de lectura corta y larga, y ayudar a la investigación sobre la regulación de la expresión génica y la detección de transcripciones relacionadas con enfermedades.

V. especificaciones del equipo

Zebra Fish (beijing) Technology co., Ltd. le proporciona información sobre los parámetros, precios, selección de modelos y principios técnicos del instrumento. para obtener más información, Póngase en contacto con nosotros.