InmenaLanzamiento de la compañíadeMisseq es un nuevo secuenciador que integra amplificación, secuenciación y análisis de datos en un solo instrumento, que puede generar más de 1 GB de datos cada vez que se ejecuta y cubre un área de solo 2 pies cuadrados. El proceso y la precisión de misseq lo convierten en una plataforma ideal para el análisis genético rápido y económico, adecuada para una amplia gama de aplicaciones. Al mismo tiempo, ilumina ha sido adquirida en grandes cantidades por la FDA y está a punto de pasar la certificación de la fda. en octubre de 12 años, el flujo de secuenciación del sistema misaq se ha actualizado a alrededor de 8g. La actualización se realiza a través de dos aspectos, uno es el aumento de la densidad de clúster, que aumentará a 15 - 17 millones después de la actualización, mientras que el número de reads leídos por Pair - end aumentará a 30 - 34 millones; Por otro lado, el flujo se mejora a través de la secuenciación de la lectura larga, que alcanza los 2 * 300bp, mientras que la velocidad de secuenciación también ha aumentado. En la actualidad, el Instituto de investigación Broad ha utilizado los reactivos existentes para lograr una secuenciación de un solo extremo de 300bp de lectura larga, y la secuenciación interna de ilumina ha completado la secuenciación de Pair - end de 2 * 400bp. Y todo esto se garantiza bajo la premisa de resultados de datos de alta calidad.

Parámetros de rendimiento de misaq

Tiempo de secuenciación y cantidad de datos de ilumina misseq

Comparación de lecturas de ilumina misseq

Flujo de trabajo

Secuenciador de segunda generación de iluminaMiseq IVGrandes características

1. ciclo experimental más corto: se necesitan 8 horas para obtener resultados de secuenciación de alta calidad de más de 100 m a partir de la preparación de la muestra.

2. proceso conveniente de preparación de muestras: se necesita una plantilla de ADN de 50 ng, y la operación automatizada de 2 horas puede completar toda la preparación de muestras.

3. principios de secuenciación: los principios químicos de la secuenciación mientras se sintetizan las plataformas gaseq e hiseq continúan.

4. función de integración completa: misaq puede completar la generación de clústeres de forma independiente, secuenciación bidireccional y análisis de datos, para que la financiación y el espacio de laboratorio ya no se conviertan en obstáculos para la investigación de ng.

Secuenciador de segunda generación de iluminaAlcance de la aplicación misseq

1. secuenciación del Transcriptoma

La Plataforma de secuenciación pishenol misseq es una plataforma de análisis de transcriptomas para especies secuenciadas del genoma. El equipo técnico de la compañía ha completado la secuenciación y análisis de transcriptomas de muchas plantas y animales, incluido el pez cebra.

2. secuenciación de la Zona V única del genoma macro 16s radn

La Zona V única (v3 \ v4) de 16s radn fue secuenciada de alto rendimiento para identificar la flora y la paleontología. El equipo técnico de paisano utilizó ilumina misseq para secuenciar con éxito las bacterias ambientales intestinales de los pollos en la región V4 de 16s radn y en combinación con Roche 454 flx + para secuenciar las regiones V1 a V3 de 16s radn.

3. secuenciación del ARN pequeño

La longitud de lectura de 1 * 35 BP coincide con la longitud de secuenciación del ARN pequeño, que es rápido y sensible. El equipo técnico de paisenno ha completado la secuenciación del ARN pequeño de los gansos y la secuenciación del ARN pequeño de varias hierbas medicinales chinas.

4. redescubrimiento: incluye redescubrimiento de todo el genoma, secuenciación simplificada del genoma y secuenciación de exones.

Ilumina misseq es muy adecuada para la redescubrimiento del genoma microbiano, que puede completar una secuenciación del genoma microbiano cada vez que se ejecuta. El 27 de diciembre de 2011, el equipo técnico de paisenno utilizó misseq para completar simultáneamente la redetección de bacterias lácticas (lactobacillus Casei Zhang y Lactobacillus Casei p8) en una sola operación, con una profundidad de cobertura genómica de 404 y 213 veces, respectivamente, en comparación con la secuencia de referencia, logrando una cobertura completa del genoma, al tiempo que detectó una variedad de variantes estructurales, incluyendo inserciones, deleciones y sitios snp, y detectó todo el plasmídeo.

Presentación de datos

* La introducción del producto y los datos anteriores provienen de ilumina, solo para referencia, con iluminaPrevalecerá.