El análisis fenotípico de alta connotación es cada vez más ampliamente utilizado en muchos campos de investigación, incluyendo la investigación de funciones genéticas, el desarrollo de medicamentos y la toxicología. La ventaja de este método es obtener información multidimensional de un solo nivel de detalle de manera muy objetiva, capaz de analizar y describir el Estado de una sola célula y compararla con los datos del análisis general. Muchos análisis fenotípicos tradicionales se basan en la selección subjetiva de unos pocos indicadores importantes para analizar en las vías a estudiar. Por lo tanto, en el análisis fenotípico tradicional, la mayoría de los cambios relacionados con la biología causados por el tratamiento experimental son fáciles de ignorar. El análisis fenotípico de una célula se compone de miles de indicadores cuantificables que caracterizan el Estado de la célula. Estos indicadores contienen información extraída de la expresión, estructura y distribución de biomarcadores. En general, Estos marcadores son identificados específicamente por el organelo y proporcionan información sobre su estructura, su relación espacial con otras estructuras subcelulares. La información clasificada de estas células puede proporcionar una base analítica efectiva para el cliente al estudiar compuestos, sustancias de moléculas pequeñas o perturbaciones genéticas. Los compuestos (moa) con mecanismos de acción similares a menudo causan cambios morfológicos celulares similares. Por lo tanto, la comparación entre los espectros fenotípicos puede proporcionar una base para el Moa de los nuevos compuestos. Del mismo modo, las interferencias genéticas en la misma vía a menudo conducen a perfiles fenotípicos similares, lo que indica que los perfiles fenotípicos se pueden utilizar en estudios genómicos funcionales de alto rendimiento.