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Piso 3, edificio 6, No. 537 songda road, Distrito de qingpu, Shanghai
Shanghai Bono Biotechnology Co., Ltd
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Total de plantasARNLa extracción es el paso básico central de la investigación en biología molecular, y su calidad determina directamente la secuenciación del Transcriptoma y la cuantificación de la fluorescencia en tiempo real.PCRY el éxito o el fracaso de los experimentos aguas abajo. Plantas, sin embargoParedes celulares duras, endógenas activasRNaseY abundantes metabolitos secundarios de polifenoles de polisacáridos, a menudo conducen a métodos de extracción tradicionales ineficientes. En particular, el molienda manual tradicional de nitrógeno líquido tiene un bajo flujo de tratamiento, una mala repetibilidad de la operación y es fácil de causar debido al calentamiento de la molienda.ARNProblemas como la degradación se han convertido en cuellos de botella que restringen la investigación.
Este esquema optimiza los parámetros de operación y el proceso del molino de organización de alto rendimiento de escritorio a través del sistema, y construye un conjunto deRotura de alta eficiencia, protección a baja temperatura durante todo el proceso, salida estandarizadaEl sistema integrado de preprocesamiento de muestras tiene como objetivo resolver sistemáticamente los problemas técnicos anteriores.
I. análisis de las dificultades técnicas y el mecanismo de respuesta del molino
Para mostrar claramente los principios técnicos de este programa, pondremos las plantasARNLos principales desafíos de la extracción se comparan con el mecanismo de diseño específico del molino de la siguiente manera:
Desafíos centrales |
Mecanismo de respuesta técnica del molino |
1. Trastornos de rotura física: la estructura de la pared celular es sólida y los medios convencionales son difíciles de romper completamente. |
Vibración de alta frecuencia y rotura eficiente: sistema de oscilación vertical..10 a 70 HzZirconia de accionamiento ajustable/.Las cuentas molidas de carburo de tungsteno, a través del impacto y Corte de alta velocidad, se pueden obtener en30Lograr la rotura completa del tejido fibroso en segundos y mejorar la eficiencia10Más del doble. |
2. Riesgo de biodegradación: endógenoRNaseFuerte actividad, fácil de causar calor de molienda y exposición operativaARNDegradación. |
Inhibición de la actividad enzimática a baja temperatura durante todo el proceso: equipado con un módulo de refrigeración de prerefrigeración de nitrógeno líquido o compresor, la temperatura de la cavidad de molienda se puede controlar de manera estable en-30℃A-50℃, inhibición a nivel físicoRNaseActividad. |
3. Interferencia de la contaminación química: los polifenoles son fáciles de oxidar, los Polisacáridos son fáciles de coprecipitar, afectandoARNLa pureza reacciona con aguas abajo. |
Diseño de la estructura antiincrustante: se utilizan tanques de molienda completamente cerrados y cuentas de molienda desechables para evitar la contaminación cruzada; Los materiales de Zirconia de alta pureza reducen la adsorción de iones metálicos. |
4. Límite de tamaño del experimento: bajo flujo de molienda manual, largo tiempo y grandes diferencias entre lotes. |
Procesamiento paralelo de alto rendimiento: apoyo96 / 192La placa de agujero funciona simultáneamente, y la molienda de un solo lote se puede hacer en10Se completa en minutos y mejora la eficiencia20Más del doble, y se pueden almacenar parámetros para estandarizar. |

II. procesos operativos estandarizados (tomando como ejemplo las hojas de las plantas)
1. Preparación experimental
Equipos y consumibles: Molino de tejido de alto rendimiento de escritorio (recomendado7PulgadaTFTPantalla táctil, adaptadores preconfriados de nitrógeno líquido, perlas molidas de Zirconia (diámetrode 3 a 5 mm), ningunoRNasa 2 mlTubo centrífuga,ARNKit de extracción.
protección de seguridad: se deben usar guantes anticongelantes, gafas antishock y ropa protectora durante toda la Operación para garantizar que la cubierta esté cerrada y que la función de frenado de emergencia sea normal.
2. Pasos operativos básicos
Preprocesamiento de muestras: Yu WuRNaseMesa de trabajo, recoger50 a 100 mgHojas frescas, cortadasde 1 a 2 mmFragmentos, lanzados rápidamente con1 ml de aguaSolución de craqueo y1En el tubo centrífuga de las cuentas molidas, cubra y marque.
Preconfriamiento del conector: sumerja el conector colocado simétricamente en el tubo de muestra en su conjunto en nitrógeno líquido1 - 2Minutos hasta que el nitrógeno líquido deje de hervir y asegúrese de que la muestra se congele.
Configuración de los parámetros del instrumento: iniciar el modo de baja temperatura del molino y esperar la temperatura de la cavidad≤ - 30℃Después, establezca los parámetros: frecuencia30-35 Hz, tiempo45 - 60Segundos, activar aceleración/.Procedimiento de desaceleración..2Cambio en segundos).
Iniciar el procedimiento de molienda: retire rápidamente el conector del nitrógeno líquido..Este paso al inicio debe controlarse en30En segundos) instale y cierre inmediatamente la tapa y inicie el programa. Una vez completado, el tubo de muestra se transfiere rápidamente a la Caja de Hielo.
ARNRecuperación inicial:4℃, 5000 rpmCentrifugadora30Segundos para mezclar el lisado con el homogeneizado y luego entrar directamente en el kit.ARNPasos de purificación.
3. Precauciones clave
Control de tiempo: estricto cumplimiento“Oro30segundo",Principio para evitar que las muestras se descongelen antes del arranque.
Principio de equilibrio: colocación simétrica del tubo de muestra, la diferencia de peso del agujero único no superade 10 mg.
Adaptación de parámetros: las diferentes organizaciones deben optimizar los parámetros, con referencia específica a la siguiente tabla:
plantaARNTabla de optimización de parámetros de extracción y molienda
Tipo de tejido vegetal |
Material de cuentas molidas |
Frecuencia recomendada(Hz) |
Tiempo de molienda(segundo(...) |
Recomendaciones especiales de optimización |
Hojas jóvenes y tiernas (arabidopsis thaliana, tabaco) |
Zirconia |
28 - 32 |
30 - 45 |
Proceso estándar para evitar la liberación excesiva de pigmentos por molienda excesiva |
Hojas maduras (arroz, trigo) |
Zirconia |
30 - 35 |
45 - 60 |
Se puede moler dos veces (baño de hielo separado)1Min) |
Raíces leñosas (manzanas, álamos) |
Zirconia |
32 - 38 |
60 - 90 |
Las muestras se cortan primero.1 mmSección pequeña, el preconfriamiento de nitrógeno líquido se extiende hasta3Min |
Semillas duras (maíz, soja) |
Carburo de tungsteno |
35 - 40 |
90 - 120 |
Adopta el modo de molienda intermitente (trabajo)30segundo/.Pausa10Segundos), rotura mejorada |
Tejido pulpa múltiple (pulpa de tomate, kiwi) |
Zirconia |
25 - 30 |
20 - 40 |
Reducir la cantidad de lisado a800 μLEvitar la dilución excesiva |
III. ventajas del programa y evaluación de la calidad
1. ventaja central
Calidad estable: baja temperatura y garantía de rotura eficiente durante todo el procesoARNIntegridad,AdemásEl valor se estabiliza en8.5Lo anterior (método tradicional aproximadamente6.0); Visualización por gel de agarosaARNr28S/18SLas tiras son claras y no hay cola de degradación.
Alto rendimiento y buena pureza: por miligramo de tejidoARNTasa de gananciade 4 a 6 μg,NanodropDetecciónOD260/280para2,0 – 2,1,OD260/230 ≥ 1,8Reducción de residuos de Polisacáridos60%Arriba.
Excelente eficiencia: lote único192Solo se necesita molienda de muestras15Minutos, ahorro80%Tiempo; Coeficiente de variación dentro del lote(CV)Por debajo5%, mayor repetibilidad.
Amplia aplicación: Al ajustar los parámetros, se puede adaptar a plantas especiales con alto contenido de hierbas, madera, algas y polifenoles (como árboles de té y Salvia miltiorrhiza).
2. Proceso estandarizado de evaluación de la calidad
Integridad: usoAgilent 2100Analizador biológico,≥ 8,0(criterios de secuenciación del transcriptoma) o≥ 7,0(ordinarioPCR) está calificado.
Pureza: detección por espectrómetro ultravioleta,OD260/280Relación1,9 – 2,2Y sin picos diversos,OD260/230 ≥ 1,7.
Tasa de ganancia: el método cuantitativo de fluorescencia determina con precisión la concentración y calcula la eficiencia de extracción en combinación con el peso de la muestra inicial.
IV. Resumen y perspectivas
El Molino de tejido de alto rendimiento de escritorio pasa “Rotura de alta frecuencia-Protección a baja temperatura-Diseño antiincrustante", La triple sinergia tecnológica ha conquistado sistemáticamente las plantas.ARNLos cuatro problemas centrales de la extracción. Su proceso de estandarización no solo garantizaARNAlta calidad y alta estabilidad de las muestras, con un mejor flujo como estudio de biología molecular vegetal a gran escala (por ejemploGWAS,ncARNLa investigación) proporciona un fuerte apoyo.
De cara al futuro, con el desarrollo del control inteligente y la tecnología de Internet de las cosas, este tipo de dispositivos se integrarán.IASistema adaptativo de parámetrosLograr la coincidencia inteligente de los esquemas de molienda y la trazabilidad en tiempo real de los datos experimentales, y promover la investigación botánica hacia un mayor nivel de estandarización, automatización e inteligencia.